Uno de los momentos relevantes de la historia de las colecciones está profundamente relacionado con la actividad de Denis Peyrony, inagotable investigador al que debemos el descubrimiento de muchos yacimientos, del que procede el primer fondo de colecciones, origen de la creación del Museo de Eyzies, a comienzos del siglo XX.
Desde entonces, la ampliación de las colecciones ha continuado de forma sostenida, en particular durante los quince últimos años, gracias al apoyo de donantes y de arqueólogos.
Algunas colecciones son el resultado de una vida totalmente dedicada a la Prehistoria.
Entre las más eminentes personalidades científicas, gracias a las que conocemos en la actualidad este patrimonio prehistórico considerable y que nos lo han transmitido, cabe mencionar F. Bordes, J. Gaussen, L. Pales, G. Laplace, G. Bonifay, J.-P. Texier, Cl. Barrière, P. Fitte, J.-Ph. Rigaud, J. Tixier y muchos más.
Cabe añadir prestigiosos depósitos de otros museos (como el del Museo de Antigüedades Nacionales), más de un centenar de generosos donantes y también obras de campo, directamente apoyadas por el Museo Nacional de Prehistoria.
